No ano 298 da era dos deuses, as meninas da escola primária Sumi Washio, Sonoko Nogi e Gin Minowa são encarregadas de uma missão importante. Eles devem se tornar heróis e lutar contra Vertex, um inimigo misterioso que está atacando Shinju-sama, a árvore de Deus que protege Shikoku, a única área do mundo que ainda é habitável. O que eles não sabem, é que essa luta vai custar mais do que eles poderiam ter imaginado.