Um satélite espacial sai de órbita, cai em um lugar afastado da cidade de Piedmont, Utah, e cruza o caminho de dois adolescentes. Mesmo sem saber o que o objeto guarda, os dois o levam até a comunidade. Ao abri-lo, os habitantes liberam um microorganismo fatal que, mais tarde, recebe do Exército Norte-Americano o nome de Andrômeda. Um time de cientistas, liderado pelo Dr. Jeremy Stone (Benjamin Bratt), é enviado à cidade justamente para investigar o porquê da manifestação do vírus. Equipados em um laboratório subterrâneo, o time tem de encarar dois desafios complicados e, ao mesmo tempo, intrigantes: descobrir a origem e os meios de impedir a proliferação do inimigo invisível, antes que a humanidade seja exterminada.