Tatsumiyajima é a ilha central no meio de um pequeno conjunto de ilhas em um remanso sonolento das ilhas japonesas. Não acontece muita coisa lá, e os jovens da ilha vão para a escola sabendo que suas vidas tendem a permanecer pacíficas e sem perturbações. Ou assim eles foram ensinados ... mas a verdade é diferente. O destino da humanidade está em jogo, e Tatsumiyajima é a última linha de defesa contra um inimigo hostil e incompreensível. No centro de tudo, lutando pela existência contínua da Humanidade, é o robô gigante Fafner, o dragão que guarda o tesouro final da humanidade.